单病种住院医疗费结算，是指市社会保险经办机构与定点医院之间，对医保患者住院医疗费的一种结算方式，即对某种疾病或治疗方式，经过调查测算平均应该花多少钱，来确定一个比较客观的平均结算标准，超支不补，结余归医院所有。
    目前，我市适用于单病种结算的共33个，分为甲、乙两类管理。甲类单病种包括肝移植等12个，一般属技术难度较高的大型手术项目，乙类单病种包括食管癌根治术、人工关节置换术等21个。